1、占比不達(dá)標(biāo)。研發(fā)人員不達(dá)標(biāo)，研發(fā)費(fèi)用占比不足，高品收入占比不達(dá)標(biāo)。某企業(yè)不注重規(guī)劃，年底企業(yè)銷售收入激增，導(dǎo)致年底找研發(fā)費(fèi)用的情況頻發(fā)。某研發(fā)型科技企業(yè)沒有提前規(guī)劃，年度入賬政府補(bǔ)貼800萬，導(dǎo)致補(bǔ)貼收入大于自產(chǎn)銷售收入，高新技術(shù)產(chǎn)品收入占比不達(dá)標(biāo)。1.比例不達(dá)標(biāo)。R&D人員不達(dá)標(biāo)，R&D費(fèi)用占比不足，優(yōu)質(zhì)產(chǎn)品占比不達(dá)標(biāo)。某企業(yè)不注重規(guī)劃，年末銷售收入激增，導(dǎo)致年末研發(fā)費(fèi)用頻繁。某R&D科技企業(yè)未提前規(guī)劃，錄得年度政府補(bǔ)貼800萬元，導(dǎo)致補(bǔ)貼收入大于自產(chǎn)銷售收入，高新技術(shù)產(chǎn)品收入占比不達(dá)標(biāo)。
2.不同系統(tǒng)對(duì)相同數(shù)據(jù)的報(bào)告不一致。統(tǒng)計(jì)季報(bào)、火炬年報(bào)和高年報(bào)數(shù)據(jù)不一致。某企業(yè)不重視高新技術(shù)內(nèi)容的申報(bào)，導(dǎo)致稅務(wù)系統(tǒng)與高新技術(shù)系統(tǒng)之間R&D費(fèi)用、員工總數(shù)、R&D人員數(shù)量不一致，導(dǎo)致重新認(rèn)定時(shí)稅務(wù)解釋困難。
3.年度火炬報(bào)告中有很多交叉核對(duì)的關(guān)系。錯(cuò)誤不能報(bào)告，警告不能合理解釋。某科技企業(yè)在填報(bào)過程中，系統(tǒng)總是會(huì)報(bào)警，導(dǎo)致不能按時(shí)報(bào)送。
4.錯(cuò)過了報(bào)告時(shí)間?？萍紡d通知周期短，系統(tǒng)用戶多，截止時(shí)間系統(tǒng)將在中華人民共和國科技部關(guān)閉。
5.對(duì)技術(shù)術(shù)語(基礎(chǔ)研究與開發(fā)、科技成果、新產(chǎn)品定義、人員與項(xiàng)目關(guān)系)理解不當(dāng)導(dǎo)致填寫錯(cuò)誤，影響三年后高申報(bào)。一個(gè)新認(rèn)定的高科技企業(yè)，不知道怎么填這些數(shù)據(jù)。
6.R&D費(fèi)用占銷售收入的比例不達(dá)標(biāo)。坪山新區(qū)某公司最后導(dǎo)致去年R&D費(fèi)用嚴(yán)重偏高，稅務(wù)部門認(rèn)為存在數(shù)據(jù)采集偏高的嫌疑。
7.費(fèi)用之間的比例和項(xiàng)目之間的分配不合理。例如，項(xiàng)目間費(fèi)用的平均分配，R&D費(fèi)用結(jié)構(gòu)表中的平均分配，乍一看，就是專家的R&D費(fèi)用。
8.采集口徑。不能收取的費(fèi)用，如福利費(fèi)、招待費(fèi)等，目前按照《高新技術(shù)企業(yè)R&D費(fèi)用原則》、《高新技術(shù)企業(yè)工作管理指引》第195號(hào)收取，附加扣除收取原則為《財(cái)政部、科技部國家稅務(wù)總局關(guān)于完善R&D費(fèi)用稅前附加扣除政策的通知》，財(cái)稅[2015]119號(hào)， 以及《中華人民共和國國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)R&D費(fèi)用稅前附加扣除政策有關(guān)問題的公告》，中華人民共和國國家稅務(wù)總局公告2015年。
9.原始憑證不能證明是R&D費(fèi)用。某科技企業(yè)的證據(jù)鏈不完整，無法證明R&D費(fèi)用的真實(shí)性。
10.組織和協(xié)調(diào)。由于涉及到很多相關(guān)部門，部門之間的合作存在很大問題，難以明確部門的職責(zé)。
1、“做”賬。財(cái)務(wù)管理制度和內(nèi)部控制制度不健全，R&D費(fèi)用很容易由單獨(dú)的財(cái)務(wù)部門“制造”。
12.專業(yè)限制。財(cái)務(wù)人員對(duì)高專業(yè)水平有局限性，對(duì)高財(cái)務(wù)的理解不清晰。
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